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分子擁擠效應(yīng)及鏈剛性對(duì)受限條件下鏈分離的影響

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擁擠效應(yīng) 熵驅(qū)動(dòng)力染色體分離鏈剛性理論與模擬

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細(xì)菌繁殖過程中DNA向子細(xì)胞內(nèi)的分離是一個(gè)重要的生物過程。近年來，強(qiáng)受限條件下熵驅(qū)動(dòng)的鏈分離作為DNA分離的一個(gè)重要模型得到廣泛研究，然而實(shí)際細(xì)胞內(nèi)的擁擠環(huán)境和DNA鏈的剛性對(duì)DNA分離過程的影響還不清楚。我們通過朗之萬動(dòng)力學(xué)模擬的方法研究了擁擠環(huán)境和分子鏈的剛性對(duì)受限條件下分子鏈分離的影響。結(jié)果表明，擁擠劑濃度的增加加大了體系的粘度使得分子擴(kuò)散減慢，導(dǎo)致鏈分離的減速。在對(duì)摩擦系數(shù)和分離距離進(jìn)行修正后，我們發(fā)現(xiàn)擁擠的環(huán)境反而加速了鏈分離。半柔性鏈在受限納米管道內(nèi)隨著管徑的增加由Odijk區(qū)域向deGenne的區(qū)域轉(zhuǎn)變，導(dǎo)致了分離時(shí)間的非單調(diào)行為。

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liu

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2013-11-14 16:56:50

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