中心主任：周鈺明教授
實驗室主任：王明亮教授
實驗室主任：莫凌飛 教授
東南大學—紅太陽智慧工業研究中心是隸屬于東南大學和紅太陽集團有限公司的非獨立法人機構，業務分別掛靠東南大學化學化工學院、儀器科學與工程學院和紅太陽集團下屬子公司南京紅太陽生物化學有限責任公司、南京華洲藥業有限公司、安徽紅太陽生物化學有限公司、南京世界村云數據產業有限公司，受東南大學和紅太陽集團有限公司雙重領導。
智慧工業研究中心將充分發揮東南大學在學科、人才和技術方面的優勢和紅太陽集團有限公司的市場信息、資金及科技轉化能力方面的優勢，首期設置綠色農藥聯合實驗室和物聯網大數據聯合實驗室，主要開展在綠色農藥及物聯網大數據方面的創新研究，在新農藥、物聯網大數據等方面產生國際領先的原創成果。
2018年南京紅太陽生物化學有限責任公司與東南大學建立了江蘇省研究生工作站。
綠色農藥聯合實驗室主要研究方向：
1、新農藥及關鍵中間體的綠色合成，篩選新型結構或應用的農藥新品種進行路線研發，針對現有生產品種進行工藝優化、綠色化工藝研發、三廢資源化利用和無害化處理工藝等研究。
2、農藥新劑型的開發，研發具有環保、差異化的新農藥劑型以適用于不同的應用范圍。
3、研發農藥和化工生產的 DCS、 ESD生產控制系統，對重要工藝參數進行自動化采集和監控，在中控室實現工藝參數設置，提高在優化工藝條件下的自動控制水平。
物聯網大數據聯合實驗室主要研究方向：
1、面向智慧城市的物聯網技術、大數據分析模型、智能化集成化軟件互操作平臺研究。
2、面向工業互聯網的智能云端協作關鍵技術及系統、信息物理系統（Cyber-Physical System)技術與系統研究。
3、其它大數據應用、大數據分析、大數據可視化等領域相關技術研發。