科學家繪制出橡膠樹基因組草圖 有助提高天然橡膠產量
2016-06-28 來源：中國聚合物網
日本和馬來西亞研究人員合作成功繪制出精度達93.7％的橡膠樹基因組草圖，這將有助于培育更加高產的橡膠樹，提高天然橡膠的產量。
日本理化學研究所日前發布一份公報說，該研究所和馬來西亞理科大學的研究人員對東南亞廣泛栽種的橡膠樹品種“PRIM600”進行了基因組測序。他們首先利用約100個堿基短序列信息以99％以上精度進行解讀的“Illumina”方法，與7000個堿基長序列信息以85％精度解讀的“PacBio”方法組合，解讀出高于預想基因155倍的信息量，獲得了1.55Gb的橡膠樹基因組草圖。然后，對獲得的基因組草圖進行了基因組注釋，預測出約84000個遺傳基因，包含全部93.7％以上的遺傳基因信息。研究小組利用“CAGE法”對帕拉橡膠樹的葉、莖和膠乳進行RNA檢測，發現了全遺傳基因的基因表達量和轉錄起始部位。結果顯示，與葉、莖相比，膠乳的天然橡膠相關基因高出100倍以上。
膠乳是脂質和蛋白質組成的稱為“橡膠粒子”的乳白色小分子懸浮液。研究發現，橡膠粒子的蛋白質基因在染色體組上，形成了在轉錄的相同方向排列的基因簇。在獲得帕拉橡膠樹遺傳基因信息的基礎上，研究小組對各種橡膠樹育種系統重新測序，得到了品種間差異的詳細信息。
雖然橡膠樹的原產地在巴西亞馬孫熱帶雨林，但目前90%產出天然橡膠的橡膠樹都栽種在東南亞地區。全球經濟發展對天然橡膠的需求日趨增長，解讀橡膠樹的基因信息將有助于更科學高效地種植橡膠樹，獲取品質更高的天然橡膠。
要想完成全基因組測序通常需要花費大量的時間和人力，因此很多時候都是繪制基因組草圖。這一研究成果已經發表在英國《自然》雜志子刊《科學報告》上。
原文鏈接：The rubber tree genome shows expansion of gene family associated with rubber biosynthesis
膠乳是脂質和蛋白質組成的稱為“橡膠粒子”的乳白色小分子懸浮液。研究發現，橡膠粒子的蛋白質基因在染色體組上，形成了在轉錄的相同方向排列的基因簇。在獲得帕拉橡膠樹遺傳基因信息的基礎上，研究小組對各種橡膠樹育種系統重新測序，得到了品種間差異的詳細信息。
雖然橡膠樹的原產地在巴西亞馬孫熱帶雨林，但目前90%產出天然橡膠的橡膠樹都栽種在東南亞地區。全球經濟發展對天然橡膠的需求日趨增長，解讀橡膠樹的基因信息將有助于更科學高效地種植橡膠樹，獲取品質更高的天然橡膠。
要想完成全基因組測序通常需要花費大量的時間和人力，因此很多時候都是繪制基因組草圖。這一研究成果已經發表在英國《自然》雜志子刊《科學報告》上。
原文鏈接：The rubber tree genome shows expansion of gene family associated with rubber biosynthesis
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（責任編輯：xu）
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