生物化工技術(shù)是我國(guó)化工行業(yè)實(shí)現(xiàn)生產(chǎn)方式變革、產(chǎn)品結(jié)構(gòu)調(diào)整與清潔高效制造的有效手段。“十一五”期間，我國(guó)加大了對(duì)生物化工技術(shù)領(lǐng)域的科研投入，在生物催化劑定向改造、規(guī)模化的生物催化技術(shù)系統(tǒng)、生物材料和生物能源等領(lǐng)域取得重要成果。目前我國(guó)已形成了現(xiàn)代生物工業(yè)產(chǎn)業(yè)群，生物塑料、生物能源、生物基化工材料等產(chǎn)業(yè)快速發(fā)展。
“十一五”期間我國(guó)在纖維素乙醇研發(fā)領(lǐng)域已與世界先進(jìn)水平同步，建成多個(gè)大型燃料乙醇和生物柴油示范項(xiàng)目。我國(guó)第一個(gè)年產(chǎn)1萬(wàn)噸纖維乙醇示范裝置2008年在河南天冠集團(tuán)公司開始運(yùn)行；天津大學(xué)與廣西中糧建成目前世界上單套規(guī)模最大的20萬(wàn)噸/年木薯燃料乙醇生產(chǎn)裝置；長(zhǎng)春大成集團(tuán)實(shí)施玉米淀粉糖、系列變性淀粉與多元醇開發(fā)及產(chǎn)業(yè)化示范項(xiàng)目，在國(guó)際上首次建成了20萬(wàn)噸生產(chǎn)線；吉林松原來(lái)禾化學(xué)有限公司以中科院過程所的技術(shù)為依托，建成國(guó)際領(lǐng)先的30萬(wàn)噸/年秸稈煉制工業(yè)生產(chǎn)線。在微藻制生物柴油領(lǐng)域，中科院青島生物能源與過程研究所篩選了產(chǎn)油微藻藻株，大大降低了成本。
在生物催化劑定向改造和酶法生產(chǎn)生物柴油領(lǐng)域，北京化工大學(xué)開發(fā)出以脂肪酶為催化劑的綠色化學(xué)合成工藝，開發(fā)了新的脂肪酶固定化技術(shù)，成功實(shí)現(xiàn)了我國(guó)酯化用脂肪酶的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)。目前擁有我國(guó)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的國(guó)內(nèi)首家酶法年產(chǎn)10萬(wàn)噸生物柴油產(chǎn)業(yè)化項(xiàng)目已在秦皇島啟動(dòng)。
“十一五”期間，我國(guó)在生物質(zhì)基高分子新材料技術(shù)及產(chǎn)品的研究開發(fā)也取得重大成果，獨(dú)創(chuàng)了木質(zhì)纖維素有機(jī)酸分離技術(shù)體系，成功開發(fā)出高性能離子交換樹脂等新型功能材料；在聚乳酸領(lǐng)域，采用我國(guó)開發(fā)的綠色無(wú)溶劑本體聚合核心技術(shù)與生產(chǎn)裝備的聚乳酸生產(chǎn)線，成功制備出性能達(dá)到國(guó)外同類產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)的國(guó)產(chǎn)聚乳酸；PHA方面，我國(guó)目前年總產(chǎn)能超過1.5萬(wàn)噸，國(guó)PHA產(chǎn)業(yè)化種類和產(chǎn)量都處于國(guó)際領(lǐng)先地位，萬(wàn)噸級(jí)PHA裝置已經(jīng)成功試車。
在規(guī)模化生產(chǎn)的生物催化技術(shù)領(lǐng)域，由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院等單位完成的微生物農(nóng)藥發(fā)酵新技術(shù)新工藝及重要產(chǎn)品規(guī)模應(yīng)用項(xiàng)目，大幅度提高了阿維菌素、Bt、中生菌素的發(fā)酵水平；浙江工業(yè)大學(xué)開發(fā)出井岡霉素生物催化大規(guī)模生產(chǎn)井岡霉醇胺的方法，實(shí)現(xiàn)了井岡霉醇胺和高純度井岡霉素的規(guī)模化生產(chǎn)；中科院微生物研究所開發(fā)的用微生物發(fā)酵法生產(chǎn)長(zhǎng)鏈二元酸技術(shù)，使我國(guó)成為世界惟一能夠利用生物合成法工業(yè)生產(chǎn)長(zhǎng)鏈二元酸的國(guó)家。
在清潔轉(zhuǎn)化介質(zhì)創(chuàng)制領(lǐng)域，清華大學(xué)等開發(fā)出一體化膜生物反應(yīng)器成套設(shè)備，將膜分離技術(shù)與生物技術(shù)有機(jī)結(jié)合的新型廢水處理技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)從污水處理到再生水的轉(zhuǎn)變。該項(xiàng)目開發(fā)的低能耗膜-生物反應(yīng)器和膜組件單元運(yùn)行通量明顯提高，目前世界上規(guī)模最大的膜生物反應(yīng)器河水凈化工程在北京順義新城溫榆河水資源利用工程（10萬(wàn)噸/天）獲得應(yīng)用。我國(guó)還開發(fā)出以農(nóng)產(chǎn)品加工廢棄物為原料的可降解生物基高吸水性樹脂，這種農(nóng)用保水劑產(chǎn)品目前已在新疆、廣東、內(nèi)蒙古等地應(yīng)用推廣。